怎么南京会有两家博物馆，南京博物院和南京市博物馆为什么不合并的？不都是一样的吗？

1.南京博物院是省博物馆，归江苏省管理。

南京市博物馆是市博物馆，归南京市管理。

2.造成这一原因的是共和国成立之后，南京是直辖市。在这一期间，原国民政府中央博物院筹备处改名为国立南京博物院，后来去掉国立二字。直辖市选择用自己的市名为博物院冠名非常正常，就和天津博物馆、上海博物馆一样。

由于继承了原国民政府中央博物院筹备处的藏品和既有成果，南京博物院的藏品和研究并不局限在南京一地，而是拓展到中国东南地区（即原国民政府统治的核心地区）。所以在改名之后确定发展规划的时候，保持了南京博物院是东南地区物质文化史博物馆的性质，把主要任务确定为搜集保存有关东南地区考古学、民族学的实物资料和文献资料，以举办东南地区物质文化史陈列。

后来，中央政府改制，1952年9月，南京直辖市与苏南、苏北行署区合并，成立江苏省。为了举办反应江苏本省的历史文化，江苏省成立了江苏省博物馆，选址在苏州。

1959年，江苏省博物馆、江苏省文物管理委员会迁至南京博物院合署办公，后来江苏省文物管理委员会成为江苏省文物局，南京博物院和江苏省博物馆合并，因为南京博物院名声太大，所以保留了南京博物院的名义。

南京市博物馆则是1978年建立的，作为江苏省省会南京市的市博物馆。

3.总结一下：南京博物院，作为机构由江苏省文旅厅主管，名字继承了直辖市时代的取名模式，收藏和研究方向面向东南地区。这三者并不同构，在全国也屈指可数。

南京市博物馆则是省会城市市博物馆。

两者并不相同，不能合并。反而是功能相近的南京博物馆和江苏省博物馆早已合并。